Kapsaicin se veže na posebne receptorje v naših ustih, ko pride v stik s sluznico, predvsem na receptorje, imenovane TRPV1, ki so odgovorni za zaznavanje toplote in bolečine.

Kapsaicin se nahaja predvsem v membranah in tkivu, ki se nahajajo v notranjosti ploda čilija ali feferona. To tkivo se pogosto imenuje placenta ali žilnati del (povezuje semena s steno ploda), saj se kapsaicin proizvaja in shranjuje v teh delih.

Poleg tega ima kapsaicin tudi vlogo v obrambi rastline pred plenilci in mikrobi, saj odganja živali, ki bi lahko škodile rastlini.
Torej, najvišja koncentracija kapsaicina se nahaja v notranjih stenah ploda, predvsem v beli membrani okoli semen. Če želite zmanjšati pekočino, lahko odstranite beli del okrog semen.
